经济管理系的前身是1959年成立的昌吉师范学校政治教研组,1985年随着昌吉师范学校升格为昌吉师范专科学校而更名为政治教育系,2002年更名为法经系并开始招收思想政治教育本科专业和工商企业管理专科专业,2004年招收公共事业管理本科专业,2008年招收工商管理本科专业,2005年更名为经济管理系。截止到2010年,经济管理系为国家培养了3000多名合格的毕业生,其中绝大多数已成为教育战线和各领域的骨干,还有不少人走上了各级各类部门领导岗位,为经济管理系赢得了良好的社会声誉。

2005年以来,经济管理系全体教师在学院党委和行政的正确领导下,团结一致、艰苦创业、求真务实、与时俱进,成功地由单一的培养师范类人才的系室转变为以培养经济管理类人才为依托,为社会输送急需的经济类、管理类人才的系院。经济管理系有一支专业素质较高、教学经验丰富、具有较高教育水平和科研能力的教师队伍。迄今为止,有专职教师22人,其中具有高级职称教师4人,中级职称教师 16人,初级职称教师2人,具有研究生及其以上学历者22人,实现了教师队伍的“全硕化”。副高及其以上职称教师占全体教师的18%。2010年9月开始,在学院党委和行政的大力支持下,山东大学管理学院和北京林业大学经济管理学院先后派优秀的博士和挂职干部来我系帮助进行学科专业建设,取得了良好成绩。