南京林业大学有两个使用校区和一个在建校区，使用校区是淮安校区和玄武校区，在建的是白马校区。每个校区的专业基本都是一样的。

南京校区和淮安校区，基本都在南京校区。淮安校区是刚刚收购，还在搬迁中，主要有林学与风景园林学院，工学院，商学院，人文与艺术设计学院，基础课部。

只有南京一各校区。 学校学术实力雄厚，学科门类齐全，办学特色鲜明。现有8个博士后流动站、8个博士学位授权一级学科、24个硕士学位授权一级学科和18个硕士专业学位授权类别领域。现有工程学、动植学、农业科学、材料科学和化学5个ESI全球机构学科排名前1%，林业工程1个国家一流学科，林业工程、生态学2个一级学科国家重点学科，林木遗传育种、林产化学加工工程、木材科学与技术、森林保护学等4个二级学科国家重点学科，1个江苏省一级学科国家重点学科培育点，4个江苏高校优势学科，9个国家林业局重点学科（含培育），6个一级学科江苏省重点学科（含培育）。 国家重点学科数量位列江苏省属高校前列。在全国第四轮学科评估中，取得了两个“A+”（林业工程、林学）、一个“A-”（风景园林学）的好成绩，A+学科数位列全国林业高校和江苏省属高校第一

本部，和淮安校区。有土木工程学院，林学院，经管学院，家具设计学院，木材材料学院，外语学院，国际教育学院

两个校区，分别在南京和淮阴，南京主要是二本以及部分较好的本三专业学院，其他的本三都在淮阴校区

南京和淮安校区，有的单独大楼有的是几个院一起的。生化楼、计算机院、土木等是单独大楼，外语院、马克思院等是一起的。