学校设有基础医学院、临床医学院、人文信息管理学院、药学院、检验医学院、护理学院、生物医学系、公共卫生系、心理学系、思想政治理论教学部、继续教育学院11个二级院（系、部）。临床医学院下设临床医学系、医学影像系、麻醉系、康复治疗系4个系。