学校现有通信与信息工程学院、电子科学与工程学院、光电工程学院、计算机学院/软件学院、自动化学院、材料科学与工程学院、物联网学院、理学院、地理与生物信息学院、现代邮政学院、传媒与艺术学院、管理学院、经济学院、马克思主义学院、人文与社会科学学院、外国语学院、教育科学与技术学院、贝尔英才学院、海外教育学院、体育部、继续教育学院/应用技术学院、工程训练中心等22个院（部、中心），信号处理与传输研究院、信息材料与纳米技术研究院、物联网研究院、先进技术研究院、大数据研究院、信息产业发展战略研究院、人口研究院、教育部宽带无线通信技术工程研究中心等21个研究院（所、中心）及2个省“2011计划”协同创新中心，另外还举办了独立学院—南京邮电大学通达学院。

通信与信息工程学院

电子科学与工程学院

光电工程学院

计算机学院、软件学院

自动化学院

材料科学与工程学院

物联网学院

理学院

地理与生物信息学院

现代邮政学院、现代邮政研究院

传媒与艺术学院（文化艺术中心）

管理学院

经济学院

马克思主义学院

人文与社会科学学院

外国语学院

教育科学与技术学院

贝尔英才学院

海外教育学院

体育部

继续教育学院（自学考试办公室、人口干部培训中心）、应用技术学院 

工程训练中心