现有20个学院

1、信息科学与工程学院(厦门校区)

2、计算机科学与技术学院(厦门校区)

3、材料科学与工程学院(厦门校区)

4、化工学院(厦门校区)

5、机电及自动化学院(厦门校区)

6、土木工程学院(厦门校区)

7、建筑学院(厦门校区)

8、经济与金融学院(泉州校区)

9、工商管理学院(泉州校区)

10、旅游学院(泉州校区)

11、法学院(泉州校区)

12、文学院(泉州校区)

13、华文学院(厦门校区)

14、外国语学院(泉州校区)

15、公共管理学院(泉州校区)

16、数学科学学院(泉州校区)

17、美术学院(泉州校区)

18、体育学院(泉州校区)

19、哲学与社会发展学院(厦门校区)

20、音乐舞蹈学院(厦门校区)
   21、工学院(泉州校区)

22、生物医学学院(泉州校区)

23、厦航学院（厦门校区）

24、国际关系学院（厦门校区）

25、统计学院（厦门校区）
   26、厦门工程技术学院(厦门市翔安区)