学院设置了航海技术系，机电与信息工程系，港航管理系和外语系。航海技术系下设航海技术专业；机电与信息工程系下设轮机工程技术，船舶电子电气技术，机电一体化技术，应用电子技术，电气自动化技术，海洋工程技术，机电设备维修与管理，焊接技术与自动化等专业；港航管理系下设港口与航运管理，会计电算化，物流管理,港口机械应用技术等专业；外语系下设烹饪工艺与营养，国际邮轮乘务和涉外旅游等专业。